На территории стран Центральной Азии за длительный период хозяйственной деятельности скопилось огромное количество промышленных и бытовых отходов, отрицательно влияющих на состояние окружающей среды. Проблема их удаления, хранения и переработки приобретает все большее значение.
В бассейне имеется несколько газо- и нефтеперерабатывающих заводов, предприятий черной и цветной металлургии, химической и станкостроительной промышленности, которые осуществляют загрязнение среды сбросом отработанных вод, созданием свалок отходов, смываемых дождями, и загрязнением воздуха, которое возвращается на землю вместе с осадками.
В одном только Узбекистане ежегодный объем загрязненных промышленных отходов составляет 300 миллионов куб.м, из которых около 10% сбрасываются в водоемы без всякой очистки. В результате деятельности предприятий горно-металлургического комплекса в регионе скопилось более 25 млрд. тонн промышленных отходов, значительную часть которых составляют токсичные отходы цветной металлургии. Не меньшую проблему представляют бытовые отходы, повсеместно содержащие такие токсичные элементы, как ртуть, кадмий и другие. Зачастую бытовые отходы собираются вместе с промышленными. В странах региона не существует современной системы для правильного распределения твердых и опасных промышленных отходов (система селективного сбора), вторичной переработки отходов, что имело бы как экономический, так и природоохранный эффект.
